تكامل تعداد إبل شبه الجزيرة العربية مع إشارات الاختلاف الجغرافي بناءً على بيانات التسلسل الجيني الكاملة

منزل واحد متواضع Camellus traumatorius (جمل تروميداري) وذات سنامين كاميلوس بكتيريانوس (الجمل البكتيري) ، باستثناء البرية الجمل البري، أسس قبيلة كاميليني في العالم القديم من عائلة كاميليدي. وصل أسلاف هذه القبائل ، التي انفصلت عن العالم الجديد لاميني منذ حوالي 16.3 مليون سنة (ميا) ، إلى حوالي 6.5-7.5 ميا أوراسيا عبر جسر بيرينغ الأرضي. حوالي 4.4 ميا ، بعد تمييز الإبل ذات القرن الواحد عن الحيوانات ذات القرنين ، تم تربية الإبل البكتيرية من أسلافها البرية منذ حوالي 5000-6000 عام ، معظمها في شرق آسيا. تبع ذلك تكاثر إبل الجمل العربي في الجزء الجنوبي الشرقي من شبه الجزيرة العربية منذ 3000-4000 سنة.¹.

تظهر الإبل الجملية والبكتيرية توزيعًا جغرافيًا واسعًا نظرًا لاستخدامها التاريخي في التجارة والنقل لمسافات طويلة. تتواجد إبل الجمل العربي بشكل رئيسي في المناطق الصحراوية وشبه القاحلة في إفريقيا وشبه الجزيرة العربية وجنوب غرب آسيا ، بينما تنتشر الإبل البكتيرية بشكل رئيسي في جميع أنحاء شرق ووسط آسيا.². في العديد من البلدان ، على سبيل المثال ، يوجد كلا نوعي الإبل المستأنسة في العديد من البلدان ، بما في ذلك إيران والهند وتركيا وكازاخستان ، ويمكن أن تنتج الأنواع الهجينة الأنثروبولوجية بينها حيوانات ذات قوة وتحمل أكبر – وهي شائعة الاستخدام في طرق التجارة طويلة المدى .¹.

في شبه الجزيرة العربية ، تُصنف إبل تروميداري وفقًا لمعايير مختلفة ، على سبيل المثال لون الغلاف والموقع البيئي وإنتاجيتها ، على الرغم من عدم وجود نظام تكاثر تم إنشاؤه عن طريق التحليل الجيني. من حيث لون المعطف ، تسمى الإبل ذات ألوان المعطف البني الداكن إلى الأسود Mahahim والجمال ذات المعطف الأبيض تسمى vode. الإبل الأسفورية والمياه الضحلة لها معطف بني ، وتُصنف الإبل الثانية بشكل أساسي من البني الغامق إلى الأسود فوق أعناقها وأكتافها ومخاريطها وذيلها.³. جميع الإبل المذكورة أعلاه تستخدم في إنتاج الألبان واللحوم ، لذلك فهي مصنفة من الإبل المنتجة وتوجد في الجزء الشمالي والوسطى من شبه الجزيرة العربية. تُعرف الإبل التي يتم تربيتها خصيصًا للسباق التنافسي باسم إبل السباق وتُعرف عمومًا بالسكان المعروفين باسم عُمان في الجزء الجنوبي الشرقي من شبه الجزيرة العربية أو الحرة في شمال شبه الجزيرة العربية.^4،5.

إبل الجمل العربي من الغرب ، على سبيل المثال هاتانا وسهليا ، والجزء الجنوبي الغربي من شبه الجزيرة العربية ، على سبيل المثال تواجه Avadi و Avarik ظروفًا بيئية مختلفة من شمال ووسط شبه الجزيرة العربية. على عكس الصحراء الشاسعة التي تغطي الجزء الشمالي والوسطى من شبه الجزيرة العربية ، تعيش جمال هاتانا وأفادي في الجبال العالية ، ومن هنا يطلق عليها الجمال الجبلي أو الجبلي. في المقابل ، توجد إبل السهلية والأفاريك بشكل أساسي بالقرب من ساحل البحر الأحمر في المملكة العربية السعودية ، حيث يطلق عليها الجمال الساحلية.⁵.

يعد تقييم التباين الجيني وهيكل الإبل المصابة أول معلم في إنشاء برنامج مستدام لتربية المعلومات الوراثية. حتى وقت قريب ، كان مجال البحث هذا مقصورًا على تحليل واسمات الأقمار الصناعية الصغرى وتسلسلات الحمض النووي للميتوكوندريا الجزئية (MTDNA).^{6و7، 8}، بهبهاني وآخرون.⁹ ومينغ وآخرون.¹⁰ تسلسل فطيرة النمط الجيني (GBS) وبيانات التسلسل الجيني الكاملة ، على التوالي. يتمثل أحد التحديات الأساسية في تقدير التباين الجيني للسكان الذين يعانون من الصدمة في الوصول إلى عينات من الإبل تمثل مجموعات سكانية مختلفة وتحديد إحصاءات المعلومات لتقييم تنوعها. هناك العديد من رموز التنوع التي تقيس تنوع الكائنات الحية على المستوى البيئي ، والتي يمكن استخدامها أيضًا لتقييم التنوع الجيني لأنواع الثروة الحيوانية.^{11 ، 12}. تعتبر إنتروبيا شانون ، ومؤشر سيمبسون ، وانتروبيا رينيه أمثلة على هذه الأكواد ، والتي تُترجم رياضياً إلى أرقام معادلة تسمى أرقام التل وتستخدم للتعبير عن التنوع.¹¹. كل هذه الرموز تتحلل إلى مكونين ؛ اختلافات ألفا وبيتا ، والتي تصف زوايا التنوع المختلفة. يقيس تنوع ألفا متوسط ​​تنوع المجتمع البيئي ، بينما يقيس تنوع بيتا التغيير النسبي في تكوين الكائنات الحية بين المجتمعات البيئية.¹¹. من المعلمات المهمة التي تميز بين الأرقام الجبلية لمكوني التنوع هذين تسلسل التنوع (q) ، الذي يحدد حساسية القياس لتكرار الأنواع.¹³. عند q = 0 ، لا يتم حساب تواتر أو وفرة الأنواع. عند q = 1 ، يتم وزن الأنواع بما يتناسب مع تواترها. عند q> 1 ، يصبح رقم التل حساسًا للأنواع التي تحدث بشكل متكرر^{11 ، 13}.

في الآونة الأخيرة ، مانجو وآخرون.¹² استخدمت مقاييس التنوع البيئي هذه لقياس تنوع SNP على المستوى الفردي. يمكن أن تحسب أنشطة تنوع ألفا وبيتا المقترحة التوزيع العشوائي والعشوائي لـ SNPs مع الكروموسومات. مانجو وآخرون.¹² اقترح SNP أربعة تدابير تضامن قائمة على عدد الجبال لمقارنة أوجه التشابه بين السكان. تستكشف هذه الأنشطة أوجه التشابه بين تداخلات النيوكلوتايد على مستويات مختلفة: تداخل تداخل النيوكلوتايد المحلي (Cq._ن) يحسب نسبة SNPs المشتركة بين الأفراد ؛ تداخل SNP الإقليمي (UqN) ، والذي ينظر في نسبة SNPs التي يتقاسمها السكان ؛ تكامل SNP (مربع_ن) يقيس توازن SNP بين السكان ؛ ويكمل معدل دوران SNP (Vq_ن) يشير إلى النسبة المقارنة لدوران SNP لكل فرد.

في هذه الدراسة ، سوف نستكشف ما إذا كان يمكن التمييز جينيًا ضد مجموعات إبل ترامادول شبه الجزيرة العربية المختلفة بناءً على توزيعها الجغرافي باستخدام بيانات التسلسل الجيني الكاملة. يتم تقييم مؤشرات التنوع والتشابه على المستوى الفردي في هذه المجموعة السكانية ومقارنتها بالإبل المرجعي trometric والبكتيريا.